A. Tổ chức bộ máy:
1- Lãnh đạo Sở Y tế:
Sở Y tế có Giám đốc và không quá ba (03) Phó Giám đốc :
- Giám đốc là người đứng đầu cơ quan, chịu trách nhiệm trước Uỷ ban nhân dân tỉnh, Chủ tịch UBND tỉnh, đồng thời chịu trách nhiệm trước Bộ trưởng Bộ Y tế và trước pháp luật về toàn bộ hoạt động của Sở.
- Phó Giám đốc là người giúp việc Giám đốc Sở, phụ trách một hoặc một số lĩnh vực công tác do Giám đốc phân công, chịu trách nhiệm trước Giám đốc và trước pháp luật về các nhiệm vụ công tác được phân công. Khi Giám đốc vắng mặt, một Phó Giám đốc được Giám đốc uỷ nhiệm điều hành các mặt hoạt động của Sở.
2. Các tổ chức giúp việc Giám đốc Sở Y tế:
2.1. Văn phòng, gồm có:
- 01 Chánh Văn phòng;
- Các công chức, nhân viên thuộc các ngạch: Kế toán, văn thư, lưu trữ, lái xe; phục vụ.
2.2. Phòng Tổ chức cán bộ, gồm có:
- 01 Trưởng phòng;
- 01 Phó Trưởng phòng;
- Các chuyên viên.
2.3. Phòng Tổng hợp, gồm có:
- 01 Trưởng phòng;
- 01 Phó Trưởng phòng;
- Các chuyên viên.
2.4. Phòng Nghiệp vụ y, gồm có:
- 01 Trưởng phòng;
- Các chuyên viên.
2.5. Phòng Quản lý dược, gồm có:
- 01 Trưởng phòng;
- Các chuyên viên.
2.6. Thanh tra, gồm có:
- 01 Chánh thanh tra;
- 01 Phó Chánh Thanh tra;
- Các Thanh tra viên.
3. Các đơn vị sự nghiệp trực thuộc:
3.1. Hội đồng Giám định y khoa;
- Chủ tịch: do Giám đốc Sở kiêm nhiệm;
- Một (01) Phó Chủ tịch thường trực chuyên trách;
- Các Phó Chủ tịch kiêm nhiệm;
- Các Giám định viên.
3.2. Trung tâm Kiểm nghiệm dược phẩm, vệ sinh an toàn thực phẩm, mỹ phẩm:
- Giám đốc và một (01) Phó Giám đốc;
- Các viên chức thuộc các phòng chuyên môn nghiệp vụ.
3.3. Trung tâm Truyền thông giáo dục sức khỏe:
- Giám đốc;
- Các viên chức.
3.4. Trung tâm Y tế dự phòng tỉnh:
- Giám đốc và một (01) Phó Giám đốc
- Các viên chức thuộc các phòng, khoa chuyên môn nghiệp vụ.
3.5. Trung tâm Chăm sóc sức khoẻ sinh sản:
- Giám đốc và một (01) Phó Giám đốc;
- Các viên chức thuộc các phòng, khoa chuyên môn nghiệp vụ.
3.6. Trung tâm Phòng, chống bệnh xã hội:
- Giám đốc và không quá hai (02) Phó Giám đốc;
- Các viên chức thuộc các phòng, khoa chuyên môn nghiệp vụ.
3.7.Trung tâm Phục hồi chức năng Hương Sen:
- Giám đốc và một (01) Phó Giám đốc;
- Các viên chức thuộc các phòng, khoa chuyên môn nghiệp vụ.
3.8. Trung tâm Phòng, chống HIV/AIDS:
- Giám đốc;
- Các viên chức thuộc các phòng, khoa chuyên môn nghiệp vụ.
3.9. Bệnh viện Y học dân tộc:
- Giám đốc và không quá hai (02) Phó Giám đốc;
- Các viên chức thuộc các phòng, khoa chuyên môn nghiệp vụ.
3.10. Bệnh viện Lao và bệnh phổi:
- Giám đốc và không quá hai (02) Phó Giám đốc;
- Các viên chức thuộc các phòng, khoa chuyên môn nghiệp vụ.
3.11. Bệnh viện Suối khoáng Mỹ Lâm:
- Giám đốc và không quá hai (02) Phó Giám đốc;
- Các viên chức thuộc các phòng, khoa chuyên môn nghiệp vụ.
3.12. Bệnh viện Đa khoa Tuyên Quang:
- Giám đốc và không quá ba (03) Phó Giám đốc;
- Các viên chức thuộc các phòng, khoa chuyên môn nghiệp vụ.
3.13. Trung tâm Y tế dự phòng huyện Na Hang:
- Giám đốc và một (01) Phó Giám đốc;
- Các viên chức thuộc các phòng, khoa chuyên môn nghiệp vụ.
3.14. Bệnh viện Đa khoa huyện Na Hang:
- Giám đốc và không quá hai (02) Phó Giám đốc;
- Các viên chức thuộc các phòng, khoa chuyên môn nghiệp vụ.
3.15. Bệnh viện Đa khoa khu vực Yên Hoa, huyện Na Hang:
- Giám đốc và không quá hai (02) Phó Giám đốc;
- Các viên chức thuộc các phòng, khoa chuyên môn nghiệp vụ.
3.16. Trung tâm Y tế dự phòng huyện Chiêm Hóa:
- Giám đốc và một (01) Phó Giám đốc
- Các viên chức thuộc các phòng, khoa chuyên môn nghiệp vụ.
3.17. Bệnh viện Đa khoa huyện Chiêm Hóa:
- Giám đốc và không quá hai (02) Phó Giám đốc
- Các viên chức thuộc các phòng, khoa chuyên môn nghiệp vụ.
3.18. Trung tâm Y tế dự phòng huyện Hàm Yên:
- Giám đốc và một (01) Phó Giám đốc
- Các viên chức thuộc các phòng, khoa chuyên môn nghiệp vụ.
3.19. Bệnh viện Đa khoa huyện Hàm Yên:
- Giám đốc và không quá hai (02) Phó Giám đốc
- Các viên chức thuộc các phòng, khoa chuyên môn nghiệp vụ.
3.20. Trung tâm Y tế dự phòng huyện Yên Sơn:
- Giám đốc và một (01) Phó Giám đốc
- Các viên chức thuộc các phòng, khoa chuyên môn nghiệp vụ.
3.21. Bệnh viện Đa khoa huyện Yên Sơn:
- Giám đốc và không quá hai (02) Phó Giám đốc
- Các viên chức thuộc các phòng, khoa chuyên môn nghiệp vụ.
3.22. Bệnh viện Đa khoa khu vực ATK, huyện Yên Sơn:
- Giám đốc và không quá hai (02) Phó Giám đốc
- Các viên chức thuộc các phòng, khoa chuyên môn nghiệp vụ.
3.23. Trung tâm Y tế dự phòng huyện Sơn Dương:
- Giám đốc và một (01) Phó Giám đốc
- Các viên chức thuộc các phòng, khoa chuyên môn nghiệp vụ.
3.24. Bệnh viện Đa khoa huyện Sơn Dương:
- Giám đốc và không quá hai (02) Phó Giám đốc
- Các viên chức thuộc các phòng, khoa chuyên môn nghiệp vụ.
3.25. Bệnh viện Đa khoa khu vực Kim Xuyên, huyện Sơn Dương:
- Giám đốc và không quá hai (02) Phó Giám đốc
- Các viên chức thuộc các phòng, khoa chuyên môn nghiệp vụ.
3.26. Trung tâm Y tế dự phòng Thị xã:
- Giám đốc
- Các viên chức chuyên môn nghiệp vụ.
B. Về biên chế:
1. Căn cứ vào chức năng, nhiệm vụ và yêu cầu công tác, Giám đốc Sở Y tế phối hợp với Giám đốc Sở Nội vụ trình Uỷ ban nhân dân tỉnh quyết định số lượng biên chế hàng năm.
2. Biên chế năm 2006: 1.756 người, trong đó:
- Biên chế hành chính: 27 người;
- Biên chế sự nghiệp: 1.729 người.